多克隆抗体能识别任一抗原上的多个表位，而单克隆抗体仅检测任一抗原上的一个表位。两者都是各有优势，那么我们该选谁呢？来一起看看单抗和多抗的优缺点：

【单克隆抗体】

优点展示：
 
1. 杂交瘤制得后，就成为了恒定的再生源，所有批次都将相同–对确保实验步骤和结果的一致性和标准化非常有帮助。
 
2. 单克隆抗体通常在切片和细胞染色造成的背景较低。因为它们以更强特异性检测一个靶表位，所以不太可能与其它蛋白质发生交叉反应。
 
3. 由于具有特异性，单克隆抗体非常适于用作分析测定中的一抗，或者用于检测组织中的抗原，并且通常所产生的背景染色显著低于多克隆抗体。
 
4. 与多克隆抗体相比，单克隆抗体的同质性非常高。如果实验条件保持不变，单克隆抗体的各实验结果重现性很高。
 
5. 单克隆抗体的特异性能使其在混合物中和抗原地结合。

不足之处：

·可产生大量特异性抗体，但是可能特异性过强。

·经过抗原的化学处理后比多克隆抗体更易于丢失表位。这可通过使用同一抗原的两个或多个单克隆抗体进行补偿。

【多克隆抗体】

优点展示：
 
1. 克隆抗体可有助于放大低表达水平的靶蛋白信号，因为靶蛋白可在多个表位上结合不止一个抗体分子。但是这会给定量实验造成不利影响，因为结果将变得不准确。
 
2. 由于能识别多个表位，多克隆抗体可在IP/ChIP中得到更好的结果。
 
3. 比单克隆抗体更能容许抗原中的微小变化。
 
4. 它们会识别出与免疫原蛋白质具有高同源性的蛋白质，或者从非免疫原物种的组织样品中筛选靶蛋白，例如当未测试物种中的抗原性质未知时，有时会使用多克隆抗体。这也使得检测免疫原序列以确定是否有任何交叉反应性非常重要。

5. 多克隆抗体通常是检测变性蛋白质的。

6. 多表位通常可提供更为有力的检测。
 
7. 多克隆抗体不适用于探测抗原的特定结构域，因为抗血清通常可识别多个结构域。

不足之处：

·易于产生批次间差异。

·产生大量非特异性抗体，有时可能在某些应用中产生背景信号。

·多表位使得检测免疫原序列以确定是否有任何交叉反应性非常重要。